Gaussian 输出

项目	值
格式 ID	g16log
扩展名	.log, .out, .g16, .gal, .irc, .gau
读取	是
写入	否
Registry 角色	Reader
数据层级	坐标和 QM 结果

快速读取

Python

from molop import AutoParser

frame = AutoParser("calculation.log", parser_detection="g16log")[0][-1]
print(frame.is_normal)
if frame.energies and frame.energies.total_energy is not None:
    print(frame.energies.total_energy.m_as("hartree"))

输出约定

输出为终止状态和最终总能量，例如 True 与 -317.592366596；具体数值取决于文件。

其他结果入口见按科学性质查找字段。

MolOP 读取 Gaussian 输出文件，并提取后处理常用的结构、能量、热力学、振动、 轨道、布居、梯度、NMR、响应性质、archive 和终止状态信息。覆盖范围按计算化学用户熟悉的 Gaussian 输出内容组织；“部分支持”表示已覆盖常见或测试样例中的打印形式，但不等价于完整 Gaussian 输出语法。

能力	支持程度	可提取信息	边界
Gaussian 任务元数据	样例覆盖	软件版本、route 文本、title、电荷、自旋多重度，以及存在时累计的运行时间。	字段会被归一化；不保留原始 log 的行顺序或字节级排版。
Title card	样例覆盖	Gaussian title card 会作为归一化的任务标题暴露。	只声明标题文本；不保留周边原始 Gaussian 格式。
Route keywords 与计算设置	部分支持	原始 route 文本，以及可识别的模型化学、任务类型、色散、溶剂化、布居请求和 HF 设置。	测试外的方法专有关键字可能仍保留为 raw 文本。
Input/standard orientation	样例覆盖	Gaussian 打印的 input orientation 与 standard orientation 中的原子和坐标。	Distance matrix 和 stoichiometry 打印块不作为独立结构化字段声明。
Rotational constants	样例覆盖	Gaussian 输出中的转动常数，以帧级频率量暴露。	不单独保留 principal-axis 诊断文本。
SCF 与电子能量	部分支持	SCF、Gaussian External、reference/electronic 和方法相关能量；主 log 中的能量优先于 archive-tail 重复值。	External 能量要求 Gaussian 的 External calculation of energy ... / Energy= ... NIter= ... 返回结果或 RExternal archive 记录；不保证所有 post-HF 或 correction energy 表都结构化。
分子轨道与布居分析	部分支持	轨道能级/占据数，Mulliken charge/spin、APT、Lowdin、Hirshfeld/CM5、NPA、ESP charge series，electronic spatial extent、多极矩，以及存在时的早期 polarizability。	不解析轨道系数矩阵、NBO 轨道/键级细节，以及没有可识别逐原子表格的方案。
振动频率与 IR 强度	部分支持	频率、约化质量、力常数、IR 强度、逐模式位移向量和虚频标记。	Raman、VCD 等其他谱学变体只有在后续明确覆盖时才声明支持。
热力学	部分支持	温度、压力、分子质量、惯性矩、转动对称数、转动/振动温度、转动常数、ZPVE、热能、焓、Gibbs 自由能、熵和热容。	覆盖主要面向 frequency 类型 Gaussian 输出和已有样例。
偶极矩与 polarizability	部分支持	Gaussian 已覆盖响应性质区段中的 dipole 和 polarizability 值。	只声明样例覆盖的 response 字段；不保证所有响应性质打印变体都结构化。
NMR 屏蔽与自旋-自旋耦合	部分支持	解析 Gaussian GIAO 的逐原子 shielding tensor、源 isotropic/anisotropy、principal values，以及 Hz 单位的 total K/J 和 FC、SD、PSO、DSO 贡献矩阵。	当前覆盖标准 SCF GIAO 打印族；参考化学位移、EPR 和其他 gauge 尚未结构化。
Cartesian gradients/forces	部分支持	Gaussian forces 区段中的 Cartesian force 数组。	只声明归一化 force 数组；辅助 force diagnostics 不单独记录。
Cartesian Hessian	部分支持	Gaussian second-derivative 区段中的 Cartesian Hessian 数据。	契约是归一化 Hessian 字段，不是每个 second-derivative 诊断项。
几何优化收敛	部分支持	Berny 优化摘要，包括收敛阈值、force/displacement、energy change 和 optimized-state 标记。	测试样例外的 optimizer diagnostics 可能仍是非结构化。
Gaussian archive section	部分支持	Archive-tail 中的 metadata、坐标、能量、热力学、polarizability 和 Hessian fallback/补充字段。	已从主 log 解析出的字段优先；只有明确的 RExternal 加 archive 能量会提供电子计算成功证据，不会推断 temperature 或 pressure。
终止状态	部分支持	Gaussian 终止证据属于 segment，并参与文件级聚合，不复制到 frame。	Frame status 只保留 frame-local SCF 证据；结构化解析诊断之外的失败分类不做推断。
CPU 与 elapsed time	样例覆盖	Job CPU / elapsed-time 风格记录会累计到运行时间字段。	Per-link timing rows 不作为独立 timing record 暴露。
Link1 多步任务	部分支持	Link1 section 元数据会传播到后续帧，使多步 Gaussian 任务保留逐帧上下文。	低层 link 边界行不作为用户级记录暴露。
Registry conversion	已支持	已解析 Gaussian 输出可以通过 registry 转换为坐标格式和 graph 格式。	转换质量取决于结构和 graph 的成功恢复。

Gaussian 输出能力覆盖矩阵

g16log 是结构化 reader，不提供 Gaussian log writer。下表中的“fakeG”表示对应字段能否 参与 Gaussian-like renderer，不表示能够重建原始 Gaussian 输出。

Gaussian 输出内容	解析	结构化载体	fakeG	原文保真	当前边界
Gaussian 软件和版本	样例覆盖	qm_software、qm_software_version	支持	不支持	覆盖已有 Gaussian 版本打印形式；无法从缺失 header 的截断文件推断准确版本。
Link0/options	部分	file/frame options 文本	支持	不支持	保存已打印的 Link0 选项；fakeG 可从 %nprocshared 生成 CPU 说明，但不承诺完整资源请求结构化。
route 和 title	样例覆盖	keywords、title_card、semantic_route	支持	不支持	route 语义与 GJF 共用；标题和 route 均为归一化文本，不保留装饰线。
method、functional、basis、任务	部分	model_chemistry、task_requests 及兼容字段	部分	不适用	只结构化共用 route parser 已识别的关键词；结果性质不会仅因 route 请求而被伪造。
charge 和 multiplicity	支持	frame/file 顶层字段	支持	不支持	从 Gaussian charge/multiplicity 行或 archive metadata 提取，主日志值优先。
Link1 / 多 segment 上下文	部分	segment/frame 索引和传播后的任务元数据	部分	不支持	后续 frame 继承适用的 section metadata；低层 Link enter/leave 不作为公共业务记录。
input orientation	样例覆盖	atoms、coords	支持	不支持	解析最后适用的 input orientation；不保存表格空白和 center number。
standard orientation	样例覆盖	standard_coords、变换矩阵	支持	不支持	可计算 input/standard 刚体变换；缺少 input orientation 时可能用 standard orientation 回填坐标。
仅结构快速解析	支持	atoms、coords 和基础 frame 数据	不适用	不适用	only_extract_structure 在 orientation 后停止，不提取能量、频率、热化学等昂贵字段。
rotational constants	样例覆盖	rotation_constants	Raw/有限	不支持	以 GHz 数组暴露；fakeG 没有完整的规范化 rotational-constant renderer。
SCF/reference energy	支持	energies.reference_energy、energy observations	支持	不支持	从 SCF Done、成功的 Gaussian External 能量返回或对应 RExternal archive 记录提取；fakeG 统一写成 E(SCF)，不保留原方法标签和 cycle 详情。
MP2、MP3、MP4、MP5	部分	energies.mp*_energy	不支持	不支持	覆盖当前正则识别的 EUMP*/MP5 打印；并非所有 MP correction 和 spin-component 表。
CCSD、CCSD(T)	部分	energies.ccsd_energy、ccsd_t_energy	不支持	不支持	覆盖已测试总能量行；其他 coupled-cluster 变体和 correction table 不保证。
archive energy fallback	部分	合并后的 energies	间接	不支持	主 log observation 优先，archive 只补充缺失/重复能量，不覆盖更强的 live 证据。
总自旋	部分	total_spin.spin_square、spin_quantum_number	支持	不支持	只覆盖标准 S**2/S 打印形式。
MO 能级、占据和对称性	部分	molecular_orbitals	Raw/不支持	不支持	支持 alpha/beta、开壳层和连写数值回归；不解析完整 MO coefficient matrix。
Mulliken / spin population	部分	charge_spin_populations	Raw/不支持	不支持	支持独立表和开壳层合并 charge/spin 表；表头、总和及打印精度不保留。
APT / Lowdin population	部分	charge_spin_populations	Raw/不支持	不支持	只覆盖已有样例的标准表格。
Hirshfeld / CM5	部分	populations["hirshfeld_charges"]、populations["hirshfeld_spins"]、populations["cm5_charges"]	Raw/不支持	不支持	提取 Hirshfeld charge/spin 和 CM5 charge series。
NPA / ESP 原子电荷	部分	populations["npa_charges"]、populations["esp_charges"]	Raw/不支持	不支持	保留 frame 中最后一份完整 NPA summary 和 ESP 原子电荷表；不解析详细 NBO 轨道与键级。
electronic spatial extent	部分	polarizability.electronic_spatial_extent	Raw/不支持	不支持	只覆盖 population 区段中的标准 scalar 行。
dipole 和高阶多极矩	部分	polarizability 的 dipole、quadrupole、traceless quadrupole、octapole、hexadecapole	Raw/不支持	不支持	覆盖已测试 field-independent/response 打印；不保证全部单位和频率依赖变体。
polarizability	部分	isotropic、anisotropic、tensor 字段	Raw/不支持	不支持	合并 population、response 和 archive 来源；后出现的明确 response 数据可覆盖早期近似值。
harmonic frequencies	部分	vibrations.frequencies、虚频标记	支持	不支持	解析连写数值；不支持 anharmonic/VPT2 结果表。
reduced mass、force constant、IR	部分	vibrations 对应数组	支持	不支持	与频率按 mode 对齐；Raman activity、VCD/ROA 不在当前结构化合同。
normal-mode displacement	部分	vibrations.vibration_modes 和 axis metadata	支持	不支持	规范为 mode/atom/Cartesian；normalization 和 mass weighting 当前标为 unknown。
temperature 和 pressure	部分	frame temperature、pressure	支持	不支持	来自 frequency/thermochemistry 标准行；archive 不凭空补造缺失的温压。
molecular mass、惯性矩和转动数据	部分	thermal_informations	支持	不支持	覆盖 mass、moments、symmetry number、rotational temperatures/constants。
vibrational temperatures	部分	thermal_informations.vibrational_temperatures 及 mode indices	支持	不支持	优先映射正频 mode；数量无法一致时只保留可证明的数组关系。
ZPVE 和 thermal corrections	部分	thermal_informations 的 ZPVE/TCE/TCH/TCG	支持	不支持	使用 Hartree/particle 归一化；不包含所有分项 partition-function 诊断。
U0、UT、H、G、entropy、Cv	部分	thermal_informations	支持	不支持	覆盖 Gaussian 标准 thermochemistry summary；不是完整热化学原文模型。
Cartesian forces	部分	forces 和 axis/order/orientation metadata	Raw/不支持	不支持	数组形状固定为 (N, 3)、source atom order；orientation 当前通常为 unknown。
Cartesian Hessian	部分	hessian 和 axis/order/orientation metadata	Raw/不支持	不支持	主 second-derivative block 优先，archive 可回填；矩阵要求 (3N, 3N)。
Berny convergence	部分	geometry_optimization_status	支持	不支持	提取 force/displacement、threshold、energy change 和 optimized 标记；其他 optimizer 形式可能未结构化。
SCF 与 termination status	部分	frame-local status、segment/file 聚合 status	合成	不支持	SCF 证据属于 frame；normal/error termination 属于 segment/file。fakeG 终止行不是原始状态复现。
CPU / elapsed time	样例覆盖	累计 running_time	部分	不支持	file 汇总 segment 时间；不暴露逐 Link timing records，多帧 fakeG 会移除 frame runtime 行。
archive tail metadata/coords	部分	缺失字段 fallback	间接	不支持	archive 可补充 metadata、坐标、能量、热化学、polarizability 和 Hessian；live 数据优先。
TD excited-state 结果	不支持	无稳定公共结果合同	不支持	不支持	route 可识别 TD 请求，但 excitation energies、oscillator strengths 等结果尚未结构化。
NMR magnetic shielding	部分	nmr.gauge、逐原子 shielding_tensors、isotropic、anisotropy、principal values	不支持	不支持	覆盖标准 SCF GIAO (ppm) 打印；张量按 source atom index 对齐，Cartesian orientation 当前标记为 unknown。逐原子 shielding 可通过 qm_embedded_rdmol(embed_nmr=True) 写入 RDKit atom properties。
NMR spin-spin coupling	部分	spin_spin_coupling_k、spin_spin_coupling_j、spin_spin_coupling_k_components、spin_spin_coupling_j_components、coupling_atom_indices	不支持	不支持	将分块下三角 total 和 FC/SD/PSO/DSO K/J 表展开为 Hz 单位对称方阵；coupling 矩阵仍保留为 frame-level 原子对数据。
EPR、参考化学位移、NBO bond order 等专用结果	不支持	无稳定公共结果合同	不支持	不支持	route 请求不代表结果字段已覆盖；需要独立样例和公共语义合同。
坐标/graph 格式转换	支持	frame structure / recovered graph	不适用	不适用	坐标转换依赖成功提取结构；graph 转换还依赖键级和电荷状态恢复质量。
原始 log 无损重写	不支持	component raw snippets 仅供检查/fallback	不支持	不支持	parser 是字段提取器，不是完整 Gaussian 输出 CST；不提供 byte-for-byte writer。

capture_source_evidence=True 会保留能量、SCF 和优化收敛等来源证据，适合审计解析结论； 默认模式更偏向结果提取。无论是否捕获证据，g16log 都不承诺保存完整原始输出结构。