安装

Bash

pip install molop

验证

Bash

python -c "import molop; print(molop.__version__)"
molop --version
molop --help

molop --help 应显示 parse 命令。直接从未标记的源码运行时，版本可能带有开发版本标识。

验证输出的稳定形状为：

验证输出

Text Only

<version>
molop, version <version>
Usage: molop [OPTIONS] COMMAND [ARGS]...
...
  parse       Parse files into a FileBatchModelDisk state, then run...

两个 <version> 应一致；具体版本号和完整 help 文本随发布版本变化。

常见问题

从源码检出建立开发环境

需要可编辑源码环境时，请使用开发环境与质量门禁。面向终端用户的 示例假设 molop 命令已经位于 PATH。

导入 RDKit 和 Open Babel 时发生原生崩溃

如果先导入 Open Babel，再导入 RDKit，可能触发原生 segmentation fault。使用 MolOP 时先导入 MolOP；如果直接导入这两个原生库，请先加载 RDKit：

Python

import molop
from rdkit import Chem
from openbabel import pybel

MolOP 会在初始化 Open Babel 前先加载 RDKit，以避免原生库冲突。

开发环境

源码检出、uv sync 和测试命令属于贡献者流程，见开发环境与质量门禁。

下一步

使用共享样例完成5 分钟上手。