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模型字段

用于存储量子化学计算的输出,如 Gaussian 的 .log 文件。包含更丰富的物理化学属性。

文件级 (BaseCalcFile)

  • qm_software: (str) 量子化学计算软件名称 (e.g., “Gaussian”)。
  • qm_software_version: (str) 软件版本号。
  • keywords: (str) 计算任务的关键词/路由部分。
  • method: (str) 计算方法 (e.g., “DFT”, “HF”)。
  • basis_set: (str) 基组。
  • functional: (str) 泛函。
  • charge: (int) 分子总电荷。
  • multiplicity: (int) 分子总多重度。
  • solvent: (ImplicitSolvation) 隐式溶剂化模型信息。
  • solvent: (str) 溶剂名称 (e.g., “Water”)。
  • solvent_model: (str) 溶剂模型名称 (e.g., “PCM”)。
  • atomic_radii: (str) 溶剂模型中使用的原子半径类型。
  • solvent_epsilon: (float) 溶剂介电常数。
  • solvent_epsilon_infinite: (float) 溶剂无限介电常数。
  • temperature: (PlainQuantity) 计算温度,单位为 K
  • pressure: (PlainQuantity) 计算压力,单位为 atm
  • running_time: (PlainQuantity) 总计算耗时,单位为 second
  • status: (Status) 最后一帧的计算状态。

帧级 (BaseCalcFrame)

除了包含上述 BaseCoordsFrame 的所有结构信息外,每一帧还可能包含以下计算属性:

  • energies: Energies - 能量信息
  • electronic_energy: (PlainQuantity) 电子能量, 单位 hartree
  • scf_energy: (PlainQuantity) SCF 能量, 单位 hartree
  • mp2_energy: (PlainQuantity) MP2 能量, 单位 hartree
  • mp3_energy: (PlainQuantity) MP3 能量, 单位 hartree
  • mp4_energy: (PlainQuantity) MP4 能量, 单位 hartree
  • ccsd_energy: (PlainQuantity) CCSD 能量, 单位 hartree
  • total_energy: (PlainQuantity) 根据精度自动选择的总能量, 单位 hartree
  • thermal_informations: ThermalInformations - 热力学信息
  • ZPVE: (PlainQuantity) 零点振动能, 单位 kcal/mol
  • TCE: (PlainQuantity) 内能热校正, 单位 kcal/mol
  • TCH: (PlainQuantity) 焓热校正, 单位 kcal/mol
  • TCG: (PlainQuantity) 吉布斯自由能热校正, 单位 kcal/mol
  • U_0: (PlainQuantity) 零点能量, 单位 kcal/mol
  • U_T: (PlainQuantity) 内能, 单位 kcal/mol
  • H_T: (PlainQuantity) 焓, 单位 kcal/mol
  • G_T: (PlainQuantity) 吉布斯自由能, 单位 kcal/mol
  • S: (PlainQuantity) 熵, 单位 cal/mol/K
  • C_V: (PlainQuantity) 定容热容, 单位 cal/mol/K
  • molecular_orbitals: MolecularOrbitals - 分子轨道信息
  • electronic_state: (str) 电子态。
  • alpha_energies / beta_energies: (NumpyQuantity) Alpha 和 Beta 轨道能量, 单位 hartree
  • alpha_occupancies / beta_occupancies: (list[bool]) Alpha 和 Beta 轨道占据情况。
  • alpha_symmetries / beta_symmetries: (list[str]) Alpha 和 Beta 轨道对称性。
  • HOMO_energy / LUMO_energy: (PlainQuantity) 前线轨道能量。
  • HOMO_LUMO_gap: (PlainQuantity) 前线轨道能级差。
  • vibrations: Vibrations - 振动分析信息
  • frequencies: (NumpyQuantity) 振动频率, 单位 cm^-1
  • reduced_masses: (NumpyQuantity) 约化质量, 单位 amu
  • force_constants: (NumpyQuantity) 力常数, 单位 mdyne/angstrom
  • IR_intensities: (NumpyQuantity) 红外强度, 单位 km/mol
  • vibration_modes: (list[NumpyQuantity]) 振动模式向量。
  • num_imaginary: (int) 虚频数量。
  • charge_spin_populations: ChargeSpinPopulations - 布居分析
  • mulliken_charges / mulliken_spins: (list[float]) Mulliken 电荷和自旋。
  • apt_charges: (list[float]) 原子极化张量电荷。
  • lowdin_charges: (list[float]) Lowdin 电荷。
  • hirshfeld_charges / hirshfeld_spins: (list[float]) Hirshfeld 电荷和自旋。
  • hirshfeld_q_cm5: (list[float]) Hirshfeld CM5 电荷。
  • npa_charges: (list[float]) NPA 电荷。
  • polarizability: Polarizability - 极化率和多极矩
  • electronic_spatial_extent: (PlainQuantity) 电子空间范围, 单位 bohr^2
  • isotropic_polarizability: (PlainQuantity) 各向同性极化率, 单位 bohr^3
  • anisotropic_polarizability: (PlainQuantity) 各向异性极化率, 单位 bohr^3
  • polarizability_tensor: (PlainQuantity) 极化率张量。
  • dipole: (PlainQuantity) 偶极矩, 单位 debye
  • quadrupole: (PlainQuantity) 四极矩, 单位 debye*angstrom
  • octapole: (PlainQuantity) 八极矩, 单位 debye*angstrom^2
  • hexadecapole: (PlainQuantity) 十六极矩, 单位 debye*angstrom^3
  • bond_orders: BondOrders - 键级信息
  • wiberg_bond_order: (np.ndarray) Wiberg 键级。
  • mo_bond_order: (np.ndarray) MO 键级。
  • mayer_bond_order: (np.ndarray) Mayer 键级。
  • total_spin: TotalSpin - 总自旋信息
  • spin_square: (float) S**2 的值。
  • spin_quantum_number: (float) 自旋量子数 S。
  • single_point_properties: SinglePointProperties - 单点性质
  • vip: (PlainQuantity) 垂直电离势, 单位 eV/particle
  • vea: (PlainQuantity) 垂直电子亲和能, 单位 eV/particle
  • gei: (PlainQuantity) 全局亲电指数, 单位 eV/particle
  • geometry_optimization_status: GeometryOptimizationStatus - 几何优化状态
  • geometry_optimized: (bool) 几何结构是否收敛。
  • max_force / rms_force: (float) 最大和均方根力。
  • max_displacement / rms_displacement: (float) 最大和均方根位移。
  • energy_change: (float) 能量变化。
  • status: Status - 当前帧的计算状态
  • scf_converged: (bool) SCF 是否收敛。
  • normal_terminated: (bool) 计算是否正常终止。
  • 其他直接字段
  • forces: (NumpyQuantity) 原子受力, 单位 hartree/bohr
  • hessian: (NumpyQuantity) Hessian 矩阵, 单位 hartree/bohr^2
  • rotation_constants: (NumpyQuantity) 转动常数, 单位 gigahertz