模型字段¶
用于存储量子化学计算的输出,如 Gaussian 的 .log 文件。包含更丰富的物理化学属性。
文件级 (BaseCalcFile)¶
qm_software: (str) 量子化学计算软件名称 (e.g., “Gaussian”)。qm_software_version: (str) 软件版本号。keywords: (str) 计算任务的关键词/路由部分。method: (str) 计算方法 (e.g., “DFT”, “HF”)。basis_set: (str) 基组。functional: (str) 泛函。charge: (int) 分子总电荷。multiplicity: (int) 分子总多重度。solvent: (ImplicitSolvation) 隐式溶剂化模型信息。solvent: (str) 溶剂名称 (e.g., “Water”)。solvent_model: (str) 溶剂模型名称 (e.g., “PCM”)。atomic_radii: (str) 溶剂模型中使用的原子半径类型。solvent_epsilon: (float) 溶剂介电常数。solvent_epsilon_infinite: (float) 溶剂无限介电常数。temperature: (PlainQuantity) 计算温度,单位为K。pressure: (PlainQuantity) 计算压力,单位为atm。running_time: (PlainQuantity) 总计算耗时,单位为second。status: (Status) 最后一帧的计算状态。
帧级 (BaseCalcFrame)¶
除了包含上述 BaseCoordsFrame 的所有结构信息外,每一帧还可能包含以下计算属性:
energies:Energies- 能量信息electronic_energy: (PlainQuantity) 电子能量, 单位hartree。scf_energy: (PlainQuantity) SCF 能量, 单位hartree。mp2_energy: (PlainQuantity) MP2 能量, 单位hartree。mp3_energy: (PlainQuantity) MP3 能量, 单位hartree。mp4_energy: (PlainQuantity) MP4 能量, 单位hartree。ccsd_energy: (PlainQuantity) CCSD 能量, 单位hartree。total_energy: (PlainQuantity) 根据精度自动选择的总能量, 单位hartree。thermal_informations:ThermalInformations- 热力学信息ZPVE: (PlainQuantity) 零点振动能, 单位kcal/mol。TCE: (PlainQuantity) 内能热校正, 单位kcal/mol。TCH: (PlainQuantity) 焓热校正, 单位kcal/mol。TCG: (PlainQuantity) 吉布斯自由能热校正, 单位kcal/mol。U_0: (PlainQuantity) 零点能量, 单位kcal/mol。U_T: (PlainQuantity) 内能, 单位kcal/mol。H_T: (PlainQuantity) 焓, 单位kcal/mol。G_T: (PlainQuantity) 吉布斯自由能, 单位kcal/mol。S: (PlainQuantity) 熵, 单位cal/mol/K。C_V: (PlainQuantity) 定容热容, 单位cal/mol/K。molecular_orbitals:MolecularOrbitals- 分子轨道信息electronic_state: (str) 电子态。alpha_energies/beta_energies: (NumpyQuantity) Alpha 和 Beta 轨道能量, 单位hartree。alpha_occupancies/beta_occupancies: (list[bool]) Alpha 和 Beta 轨道占据情况。alpha_symmetries/beta_symmetries: (list[str]) Alpha 和 Beta 轨道对称性。HOMO_energy/LUMO_energy: (PlainQuantity) 前线轨道能量。HOMO_LUMO_gap: (PlainQuantity) 前线轨道能级差。vibrations:Vibrations- 振动分析信息frequencies: (NumpyQuantity) 振动频率, 单位cm^-1。reduced_masses: (NumpyQuantity) 约化质量, 单位amu。force_constants: (NumpyQuantity) 力常数, 单位mdyne/angstrom。IR_intensities: (NumpyQuantity) 红外强度, 单位km/mol。vibration_modes: (list[NumpyQuantity]) 振动模式向量。num_imaginary: (int) 虚频数量。charge_spin_populations:ChargeSpinPopulations- 布居分析mulliken_charges/mulliken_spins: (list[float]) Mulliken 电荷和自旋。apt_charges: (list[float]) 原子极化张量电荷。lowdin_charges: (list[float]) Lowdin 电荷。hirshfeld_charges/hirshfeld_spins: (list[float]) Hirshfeld 电荷和自旋。hirshfeld_q_cm5: (list[float]) Hirshfeld CM5 电荷。npa_charges: (list[float]) NPA 电荷。polarizability:Polarizability- 极化率和多极矩electronic_spatial_extent: (PlainQuantity) 电子空间范围, 单位bohr^2。isotropic_polarizability: (PlainQuantity) 各向同性极化率, 单位bohr^3。anisotropic_polarizability: (PlainQuantity) 各向异性极化率, 单位bohr^3。polarizability_tensor: (PlainQuantity) 极化率张量。dipole: (PlainQuantity) 偶极矩, 单位debye。quadrupole: (PlainQuantity) 四极矩, 单位debye*angstrom。octapole: (PlainQuantity) 八极矩, 单位debye*angstrom^2。hexadecapole: (PlainQuantity) 十六极矩, 单位debye*angstrom^3。bond_orders:BondOrders- 键级信息wiberg_bond_order: (np.ndarray) Wiberg 键级。mo_bond_order: (np.ndarray) MO 键级。mayer_bond_order: (np.ndarray) Mayer 键级。total_spin:TotalSpin- 总自旋信息spin_square: (float) S**2 的值。spin_quantum_number: (float) 自旋量子数 S。single_point_properties:SinglePointProperties- 单点性质vip: (PlainQuantity) 垂直电离势, 单位eV/particle。vea: (PlainQuantity) 垂直电子亲和能, 单位eV/particle。gei: (PlainQuantity) 全局亲电指数, 单位eV/particle。geometry_optimization_status:GeometryOptimizationStatus- 几何优化状态geometry_optimized: (bool) 几何结构是否收敛。max_force/rms_force: (float) 最大和均方根力。max_displacement/rms_displacement: (float) 最大和均方根位移。energy_change: (float) 能量变化。status:Status- 当前帧的计算状态scf_converged: (bool) SCF 是否收敛。normal_terminated: (bool) 计算是否正常终止。- 其他直接字段
forces: (NumpyQuantity) 原子受力, 单位hartree/bohr。hessian: (NumpyQuantity) Hessian 矩阵, 单位hartree/bohr^2。rotation_constants: (NumpyQuantity) 转动常数, 单位gigahertz。